Врожденная малярия имеет свои особые клинические черты, нередко приобретая атипическое течение.

Механизм возникновения врожденной малярии связан чаще всего с внутриутробным (трансплацентарным) заражением, но заражение может произойти и в момент родов при попадании инфекционного начала в плод через перерезанную пуповину из крови матери (например, при разрыве промежности). В последнем случае ребенок обычно рождается здоровым и заболевает малярией после 10−14дневного инкубационного периода.

В настоящее время описано много случаев обнаружения малярии у детей тотчас же после рождения или же на следующий день. Убедительный массовый материал по врожденной малярии представил С. К. Чинной: из 115 новорожденных от больных малярией матерей у 26 он обнаружил плазмодиев в первые же часы после рождения. А. П. Григорьев нашел паразитов у 17 новорожденных тотчас же после рождения. Врожденная малярия довольно часто встречается в бывших в недалеком прошлом колониальных жарких странах, где достигает большого распространения и где лечение ее поставлено не на должной высоте.

Клиническая картина врожденной малярии характеризуется некоторыми особенностями. Нередко дети рождаются недоношенными, с увеличенной селезенкой. Довольно часто у них в крови обнаруживаются плазмодии, в то время как типичные клинические явления отсутствуют. Обращает внимание недоразвитие, анемия, желтуха. Иногда заболевание протекает без повышения температуры; во время приступов у новорожденных наблюдаются припадки эклампсии. При лихорадочных формах наблюдаются continua в течение 56 дней.