По наблюдениям Л. М. Топоровского, большинство шанкров в области заднего прохода располагалось в складках ануса (56%). В области наружного сфинктера, на месте перехода кожи в анальный канал, шанкры находились у 32% больных. В 12% случаев первичные сифиломы локализовались в анальном канале, ближе к внутреннему сфинктеру. Шанкры, располагавшиеся в анальных складках и ближе к наружному сфинктеру, имели ракетообразную или щелевидную (трещино-подобную) форму, в области внутреннего сфинктера — овальную форму. Чаще встречались эрозивные шанкры (79%), реже — язвенные (21%). По данным автора, около 70% больных с анальными шанкрами жаловались на болезненность в области заднего прохода независимо от дефекации; почти все больные отмечали во время нее болезненность различной интенсивности.

Для установления диагноза большое значение имеет обнаружение бледной трепонемы в отделяемом с поверхности первичной сифиломы. При шанкрах в области заднего прохода, располагающихся снаружи от сфинктера прямой кишки, бледные трепонемы, как правило, выявляются легко. При локализации твердого шанкра за сфинктером (на слизистой оболочке прямой кишки) бледная трепонема обнаруживается лишь после тщательной очистки поверхности шанкра от остатков содержимого кишечника.

Следует подчеркнуть, что, по данным ряда авторов, повторные заражения сифилисом среди гомосексуалистов регистрируются в десятки раз чаще, чем среди гетеросексуалистов.