В материале, взятом у больных, например в отделяемом при остром уретрите, половинки гонококка имеют совершенно одинаковую величину. При хронической гонорее наблюдаются диплококки с неодинаковыми по величине и форме половинками ((диплококки типа Аша). При лечении сульфаниламидными препаратами и антибиотиками, особенно в недостаточных дозах, отмечается большое количество гонококков с резко измененными формой и величиной: крупные шаровидные, с истонченной стенкой, величиной до размеров эритроцита и очень мелкие пылевидные — L-формы. Такие формы очень устойчивы по отношению к препарату, вызвавшему их образование. К препаратам пенициллина устойчивость повышается в 91. Гонококк в сканирующем электронном микроскопе.
Наружная стенка (не), пили (п), колбовидные вздутия (в), перегородка несколько тысяч раз. Отдельные штаммы гонококков вырабатывают пенициллиназу — фермент, разрушающий пенициллин.
Существование фильтрующихся форм гонококков не доказано. Размножается гонококк чаще путем поперечного деления. Характерным для гонококков в мазках, приготовленных из гонорейного гноя, является их расположение внутри клеток. Жизнеспособность гонококков внутри лейкоцитов сохраняется, чаще отмечается только первая стадия фагоцитоза — захватывание, перевариваются же только первые фагоцитированные гонококки. По мере израсходования гранул, при помощи которых происходит переваривание микроба, гонококки не разрушаются и продолжают жить внутри лейкоцита, иногда размножаясь (эндоцитобиоз — жизнь внутри клетки). Лейкоциты, захватившие гонококков, сохраняют способность к дальнейшему фагоцитозу гонококков и других микроорганизмов.