Некоторые авторы находили трихомонады в крови больных, но роль трихомонемии в патогенезе заболевания сомнительна, так как эти данные не получили подтверждения. Нет убедительных доказательств паразитирования трихомонад где-либо вне мочеполовых органов. Находки паразитов в других органах, например при конъюнктивите у новорожденного, настолько редки, что лишь подтверждают склонность урогенитальных (влагалищных) трихомонад избирательно поражать мочеполовую систему.
Трихомонады считаются паразитами полостей, но нередко ведут себя как тканевые паразиты. Клинически это проявляется эрозивно-язвенными поражениями наружных гениталий, развитием мощных инфильтратов в подслизистом слое из лимфоидных, плазматических и полиморфноядерных клеток, очаговыми эрозиями и метаплазией эпителия слизистых оболочек. В общем, морфологический субстрат трихомонадных поражений не имеет какой-либо специфики. Тканевый паразитизм трихомонад объясняется литическим действием их на эпителиальные и другие клетки. Трихомонадный токсин не найден. Инсталляция в уретру здоровым мужчинам убитой культуры трихомонад не приводит к уретриту.
