Так как трихомоноз не имеет характерной клинической картины, диагноз обязательно должен быть подтвержден нахождением возбудителей при непосредственной микроскопии патологического материала или в посевах на искусственные питательные среды. Серологические методы из-за противоречивости результатов не получили практического применения, хотя имеются обнадеживающие сообщения о ценности иммунофлюоресцентной диагностики трихомоноза.
Ни один из методов не обеспечивает выявления трихомонад во всех случаях заболевания. Залогом успешной диагностики служат: а) сочетание различных методик (микроскопия окрашенных и нативных препаратов и посевы); б) многократное повторение анализов; в) взятие материала из разных очагов инвазии (уретра, простата, семенные пузырьки у мужчин, влагалище, шеечный канал, уретра, протоки бартолиновых желез у женщин) в сочетании с анализами свежевыпущенной мочи; г) правильная техника взятия материала и транспортировки в лабораторию. Разумеется, опыт и настойчивость лаборанта играют немаловажную роль. Перед взятием анализов за 5—7 дней больные не должны применять протистоцидные средства, какие-либо местные дезинфицирующие и антисептические препараты, спринцевания, влагалищные шарики и т. д.