Возбудителем гонореи является гонококк. Открыт Neisser в 1879 г. По классификации Берджи относится к роду Neisseria. Специфичность его была доказана рядом авторов.
Гонококки относятся к парным коккам; по форме сходны с кофейными зернами или почками, сложенными вогнутыми сторонами внутрь. Величина гонококка колеблется от 1,25 до 1,6 мкм в длину и от 0,7 до 0,8 мкм в поперечнике. Между половинками диплококков имеется щель; размеры ее зависят от плоскости, в которой находится гонококк; при некоторых положениях она может быть не видна. Вокруг гонококков имеется капсулоподобное образование, вследствие чего гонококки не соприкасаются между собой. При электронно-микроскопическом исследовании в сканирующем микроскопе у гонококка различают пили —тонкие нити, которым приписывают его вирулентные свойства и передачу генетической информации, и колбовидные вздутия, связанные с наружной стенкой. На ультратонких срезах хорошо видна фестончатая трехслойная наружная стенка, цитоплазматическая мембрана, также трехслойная, цитоплазма с взвешенными в ней мелкими гранулярными образованиями — рибосомами («фабрики» белка), ядерной вакуолью. Четко видна перемычка между диплококками; около нее иногда различается мезосома в виде петли, соединенной с плазматической мембраной. Эти образования расположены в местах наиболее активного роста.
