Патологические изменения со стороны нервной системы у больных поздним врожденным сифилисом — явление не редкое. По данным различных авторов эти изменения обнаруживаются У 27—43% больных в виде поражений головного мозга, юношеской спинной сухотки, джексоновской эпилепсии, атрофии зрительного нерва, умственной отсталости и др. Описаны случаи развития юношеского прогрессивного паралича. Некоторые авторы относят к проявлениям позднего врожденного сифилиса семейную атаксию. Однако детальные исследования С. Н. Давиденкова показали, что, по крайней мере, в части случаев наблюдается простое совпадение болезни Фридрейха с врожденным сифилисом.
Классические серологические реакции оказались положительными (Б. М. Пашков) у 92% больных. По Н. М. Овчинникову при позднем врожденном сифилисе, особенно скрытом, стандартные серологические реакции оказались положительными у 70—80% больных. РИБТ и РИФ, за очень редкими исключениями, дают положительный результат.
Патологические изменения в спинномозговой жидкости встречаются значительно реже, чем при ранних формах врожденного сифилиса (Б. М. Пашков, Gumpesberger, Oheme, Lindenmaye и др.). При скрытых формах нейросифилиса патологические изменения в ликворе встречаются очень часто.