Первичная атипичная пневмония стала привлекав к себе внимание исследователей с конца 30-х годов. Она занимала определенное место среди заболеваний (особенно в армии) во время второй мировой войны и изучалась рядом авторов и Комиссией по респираторным заболеваниям в США, которые установили тогда вирусную этиологию болезни, вводя в дыхательный тракт добровольцев пропущенные через бактериальный фильтр мокроту и смывы из дыхательных путей больных ПАП.

Долго не было единого мнения о характере и природе возбудителя ПАП. С открытием в 1945 г. Thomas с соавторами агглютинации сывороткой больных ПАП негеполитического стрептококка Mg (в 35—50% случаев) стали считать стрептококк Mg возбудителем ПАП (один или в сочетании с другим микробом или вирусом). Однако стрептококк Mg не вызывал патологических изменений, сходных с теми, которые вызываются ПАП, и в 25%: случаев обнаруживался у здоровых людей и больных различными заболеваниями. Агглютинация стрептококков Mg могла иметь место не только в силу специфичней сти его как возбудителя ПАП, но и изза общности антигенных свойств с истинным возбудителем болезни наподобие реакции Вейля — Феликса с протеем Xi9 при сыпно-тифозном риккетсиозе Провачека.