Серологическая диагностика раннего врожденного сифилиса имеет ряд особенностей. В первые 10—12 дней жизни новорожденного из-за неполного включения иммунной системы стандартные и специфические серологические реакции могут быть отрицательными даже при наличии клинических симптомов сифилиса. До 6 мес в организме ребенка могут циркулировать гуморальные антитела и реагины матери, что должно быть учтено при диагностике раннего скрытого врожденного сифилиса. При клинико-серологическом контроле за такими детьми на 4—6-м месяце их жизни происходит спонтанная негативация серологических реакций.

При раннем врожденном скрытом и симптомном сифилисе стандартные и специфические серологические реакции бывают положительными почти в 100% случаев. При позднем врожденном сифилисе отмечается падение напряженности инфекционного иммунитета, касающегося выработки реагинов, определяемых в стандартных серологических реакциях, которые при этой форме сифилиса бывают положительными только у 75—85% больных. Специфические серологические реакции у больных поздним врожденным сифилисом положительны в 100% случаев до специфического лечения. После проведения полноценного специфического лечения у большинства больных не наблюдается негативация РИБТ и РИФ на протяжении длительного времени, что указывает на неполную микробиологическую санацию этих пациентов.