Гонококк на искусственных питательных средах дает рост обычно через 24 ч в виде мелких росовидных колоний, бесцветных или слегка желтоватых. Края колонии ровные, гладкие, поверхность блестящая и гладкая. При микроскопическом исследовании мазков, приготовленных из таких колоний, гонококки имеют вид кокков или диплококков одинаковой величины; они грамотрицательны. Через 72 ч колонии увеличиваются в размере. При микроскопическом исследовании мазков из таких колоний гонококки полиморфные, отдельные экземпляры окрашены очень бледно, количество гонококков с сохранившейся морфологией невелико. Иногда вокруг колоний наблюдаются бородавчатые разрастания или валик —дочерние колонии.

К группе грамотрицательных микробов относятся, помимо гонококка, катаральный микрококк и менингококк. Они отличаются друг от друга по месту нахождения и по биохимическим свойствам: микрококк чаще встречается в верхних дыхательных путях и в полости рта, а менингококк —в спинномозговой жидкости. Однако в последнее время описано значительное количество случаев нахождения менингококка в мочеполовых путях, а гонококка — в полости рта. Кроме того, в полости рта нередко встречаются у здоровых людей непатогенные нейссерии. Из углеводов для дифференцирования культур применяют декстрозу, левулезу и мальтозу. Гонококк разлагает только дестрозу, катаральный микрококк не разлагает ни одного углевода, а менингококк — декстрозу и мальтозу.