Трихомонада представляет собой одноклеточный организм довольно сложного строения. Тело ее чаще всего грушевидное, но может быть овальной или неправильной формы, что связано с реакцией среды обитания, наличием ингибирующих факторов и т. д. Размеры трихомонад подвержены значительным колебаниям в зависимости от темпа размножения, условий роста и особенностей штамма. По данным Б. В. Вершинского, величина их колеблется от 8 до 24 мкм. Kraus полагает, что мелкие особи (8—11 мкм) чаще находят при остром заболевании, а крупные (30—45 мкм) — при хроническом. На переднем конце тела трихомонады имеются четыре свободных жгутика, отходящих от блефаропластов, расположенных под внешней оболочкой. Пятый (возвратный) жгутик идет назад примерно до трети длины тела, образуя край ундулирующей мембраны, сформированной из перипласта (внешняя оболочка). Небольшое ядро лежит ближе к переднему концу тела. Через все тело трихомонады, от зоны блефаропластов до заднего конца, проходит опорный стержень — аксостиль, выступающий наружу в виде шипика. В электронном микроскопе видны круглые гранулы, образующие конгломераты около ядра, большие пищеварительные вакуоли, иногда содержащие остатки пищи и фагоцитированные бактерии, а также другие органоиды.
