Большему или меньшему количеству лейкоцитов с фагоцитированными гонококками придавалось не только диагностическое, но и прогностическое значение. Наличие значительного количества лейкоцитов с внутриклеточными гонококками истолковывалось как благоприятное явление. Однако этот признак ненадежен, так как количество гонококков зависит как от стадии болезни (при острой гонорее их больше, при хронической меньше), так и от способа взятия материала: в свободно стекающей капле их много, при взятии непосредственно с поверхности слизистой оболочки мало. Гонококки могут находиться и внутри эпителиальных клеток и внутри простейших — трихомонад, сохраняя свою жизнеспособность. Такие трихомонады с фагоцитированными гонококками могут быть источниками рецидивов гонореи.

Расположение гонококков внутри трихомонад имеет значение и для лечения, так как трихомонадоцидные средства не действуют на гонококков, а пенициллин, применяемый для лечения гонореи, не действует на трихомонад. Следовательно, гонококки внутри трихомонад недоступны для пенициллина.